Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRM3Q9NNZ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM3Q9NNZ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms