Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMURF2Q9HAU4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms