Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VIPAS39Q9H9C1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIPAS39Q9H9C1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIPAS39Q9H9C1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms