Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNCQ9H7C4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNCQ9H7C4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNCQ9H7C4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms