Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPF2Q9H7B2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPF2Q9H7B2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPF2Q9H7B2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms