Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPAP3Q9H6T3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPAP3Q9H6T3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms