Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOJQ9H4E5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOJQ9H4E5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms