Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXF3Q9H4D5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF3Q9H4D5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF3Q9H4D5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms