Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHD4Q9H223 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms