Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM117Q9H0C3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM117Q9H0C3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM117Q9H0C3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM117Q9H0C3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM117Q9H0C3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM117Q9H0C3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM117Q9H0C3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM117Q9H0C3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms