Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SENP6Q9GZR1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SENP6Q9GZR1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms