Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ROPN1BQ9BZX4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms