Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRNKL1Q9BZJ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRNKL1Q9BZJ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRNKL1Q9BZJ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CRNKL1Q9BZJ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms