Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF4Q9BZC1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF4Q9BZC1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF4Q9BZC1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms