Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX4Q9BYU1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX4Q9BYU1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms