Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP3-1Q9BYR8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms