Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PCGF6Q9BYE7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PCGF6Q9BYE7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PCGF6Q9BYE7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms