Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY42

RTFDC1, Protein RTF2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTFDC1Q9BY42 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
RTFDC1Q9BY42 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTFDC1Q9BY42 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms