Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A8Q9BY19 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A8Q9BY19 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms