Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRRTQ9BXP5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRTQ9BXP5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms