Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SALL3Q9BXA9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SALL3Q9BXA9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms