Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NDUFAF3Q9BU61 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms