Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNPY3Q9BT09 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPY3Q9BT09 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms