Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTKNQ9BST9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms