Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PYM1Q9BRP8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PYM1Q9BRP8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYM1Q9BRP8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms