Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAAF1Q9BRP4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PAAF1Q9BRP4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms