Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MESP1Q9BRJ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms