Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGME1Q9BQP7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGME1Q9BQP7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.7 ms