Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
YME1L1Q96TA2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YME1L1Q96TA2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201 ms