Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms