Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DCLRE1CQ96SD1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DCLRE1CQ96SD1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms