Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CSRNP1Q96S65 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSRNP1Q96S65 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms