Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CICQ96RK0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CICQ96RK0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms