Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSSK3Q96PN8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms