Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZIM3Q96PE6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIM3Q96PE6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms