Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RILPQ96NA2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RILPQ96NA2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms