Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP4Q96MN2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP4Q96MN2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms