Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL15Q96M94 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms