Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00479Q96M42 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms