Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC17Q96LX7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC17Q96LX7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms