Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms