Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SENP8Q96LD8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SENP8Q96LD8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms