Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM47Q96LD4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM47Q96LD4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms