Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CABS1Q96KC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CABS1Q96KC9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms