Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC136Q96JN2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC136Q96JN2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC136Q96JN2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms