Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms