Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF496Q96IT1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF496Q96IT1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms