Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNF8Q96H20 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNF8Q96H20 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNF8Q96H20 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms