Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHMP6Q96FZ7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms