Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN17Q96FV3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms